Wie so ziemlich alles hat auch das Fernstudium ein paar Nachteile. Zunächst verlangt das Fernstudium einen sehr hohen Anteil an Eigenmotivation. Wenn man abends von getaner Arbeit nach Hause kommt, muss man sich noch ausreichend motivieren können, um sich zum Lernen für das Fernstudium hinzusetzen. Auch die Kosten des Fernstudiums sind zu beachten. Diese variieren je nach Anbieter und Studiengang. Oft sind staatliche Anbieter wie die Fernuniversität Hagen privaten Anbietern vorzuziehen, da diese günstiger sind. Auf jeden Fall lohnt ein Vergleich der verschiedenen Anbieter für Fernstudiengänge.

Da man allein lernt, lässt es sich gut schummeln, nur ist das Selbstbetrug und bringt letztendlich bei der abzulegenden Prüfung gar nichts. Mitunter kann es zu Verzögerungen im Erhalten des Lernmaterials kommen. Teilweise wird eine gewisse Berufspraxis oder ein mehrmonatiges Praktikum für ein Fernstudium als Voraussetzung verlangt.